食品在生产、保存、运输和销售过程中极易污染变质。通常可以采用高温、干燥、烫漂、巴氏灭菌、冷冻以及防腐剂等常规技术来实现对食品的杀虫灭菌与保鲜。但往往影响食品的原有风味和营养成份。而微波杀菌设备是使食品中的微生物，同时受到微波热效应与非热效应的共同作用，使其体内蛋白质和生理活动物质发生变异，而导致微生物体生长发育延缓和死亡，达到食品灭菌、保鲜的目的。
微波杀菌设备的优点：
1、时间短、速度快 常规热力杀菌是通过热传导，对流或辐射等方式将热量从食品表面传至内部。要达到杀菌温度，往往需要较长时间。微波杀菌是微波能对细菌等微生物直接作用，利用热效应与非热效应的原理，达到快速升温杀菌的目的，处理时间大大缩短，各种物料的杀菌作用一般在3-5分钟。
2、节约能源 常规热力杀菌往往在环境及设备上存在热损耗，而微波杀菌是直接对食品产生作用，因而额外的热能损耗很低。此外，其电能到微波能的转换效率在70-80%，一般可节电30-50%。
3、表面和内部都同时进行 常规热力杀菌是从物料表面开始，然后通过热传导传至内部。存在内外温差。为了保持食品风味，缩短处理时间，往往食品内部没有达到足够温度而影响杀菌效果。由于微波具有穿透作用，对食品进行整体处理时，表面和内部都同时受到作用，所以杀菌均匀。
4、低温杀菌能食品原有的味道和营养成份不流失 微波杀菌是通过特殊热效应和非热效应杀菌，杀菌温度比常规热力杀菌低很多。实践表明，一般杀菌温度在75-80℃就能达到效果，此外，微波处理食品能保留更多的营养成份和色、香、味、形等风味，且有膨化效果。
5、便于控制，没有热惯性。设备能即开即用，操作灵活方便，微波功率从零到额定功率连续可调、传输速度从零连续可调，便于控制。
6、改善劳动条件，节省占地面积且应用广泛。设备的工作环境温度低、噪音小，极大地改善了劳动条件。整套微波设备的操作人员只需2-3人。
7、设备简单，工艺先进。与常规消毒杀菌相比，微波杀菌设备，不需要锅炉，复杂的管道系统，煤场和运输车辆等，只要具备水、电基本条件即可。
微波杀菌设备的技术应用范围极广阔，微波杀菌设备技术在食品加工中应用仅是其中的一小部分。
